Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm6899Q3USS0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6899Q3USS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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