Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm20Q3UQS8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Rbm20Q3UQS8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm20Q3UQS8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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