Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp30Q3UN04 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp30Q3UN04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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