Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ell2Q3UKU1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms