Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc61Q3UJV1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms