Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms