Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnrc6cQ3UHC0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnrc6cQ3UHC0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms