Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc58Q3UGP9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc58Q3UGP9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms