Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek10Q3UGM2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek10Q3UGM2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms