Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Garem1Q3UFT3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Garem1Q3UFT3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms