Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms