Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms