Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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