Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms