Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd8Q3TA59 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jmjd8Q3TA59 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms