Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shroom4Q1W617 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms