Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptcd3Q14C51 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptcd3Q14C51 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms