Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli2Q0VGT2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms