Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2b3Q0VF55 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms