Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms