Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms