Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms