Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf541Q0GGX2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms