Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox4Q06831 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms