Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a1Q05722 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms