Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms