Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms