Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl7Q03366 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms