Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms