Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms