Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RykQ01887 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RykQ01887 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RykQ01887 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms