Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme2Q01768 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms