Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms