Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms