Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms