Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.8 ms