Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds1P98191 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms