Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps3aP97351 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3aP97351 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms