Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mesp1P97309 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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