Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms