Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms