Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms