Protein–RNA interactions for Protein: P70172

Slc10a2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a2P70172 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc10a2P70172 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms