Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms