Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta1P68134 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta1P68134 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Acta1P68134 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta1P68134 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta1P68134 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta1P68134 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta1P68134 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta1P68134 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta1P68134 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta1P68134 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta1P68134 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta1P68134 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta1P68134 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta1P68134 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta1P68134 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms