Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtnP63089 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtnP63089 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtnP63089 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtnP63089 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtnP63089 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtnP63089 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtnP63089 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtnP63089 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtnP63089 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtnP63089 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms