Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms