Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta2P62737 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta2P62737 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Acta2P62737 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Acta2P62737 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta2P62737 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms