Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms