Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms